MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Flavobacterium columnare ATCC 49512 chromosome

Total Repeats: 79993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016510	AATT	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016510	AAT	2	6	53	58	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959084
3	NC_016510	AAT	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959084
4	NC_016510	T	6	6	115	120	0 %	100 %	0 %	0 %	365959084
5	NC_016510	T	7	7	145	151	0 %	100 %	0 %	0 %	365959084
6	NC_016510	T	7	7	170	176	0 %	100 %	0 %	0 %	365959084
7	NC_016510	GTT	2	6	177	182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365959084
8	NC_016510	TCT	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959084
9	NC_016510	TCT	2	6	254	259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959084
10	NC_016510	ATCA	2	8	316	323	50 %	25 %	0 %	25 %	365959084
11	NC_016510	T	6	6	389	394	0 %	100 %	0 %	0 %	365959084
12	NC_016510	GTAA	2	8	398	405	50 %	25 %	25 %	0 %	365959084
13	NC_016510	AAT	2	6	426	431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959084
14	NC_016510	TAT	2	6	529	534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959084
15	NC_016510	AT	3	6	533	538	50 %	50 %	0 %	0 %	365959084
16	NC_016510	CAA	2	6	548	553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365959084
17	NC_016510	GATT	2	8	735	742	25 %	50 %	25 %	0 %	365959084
18	NC_016510	ACTT	2	8	751	758	25 %	50 %	0 %	25 %	365959084
19	NC_016510	TTC	2	6	759	764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959084
20	NC_016510	ATC	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959084
21	NC_016510	TGA	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959084
22	NC_016510	ATC	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959084
23	NC_016510	A	6	6	813	818	100 %	0 %	0 %	0 %	365959084
24	NC_016510	AATT	3	12	923	934	50 %	50 %	0 %	0 %	386262267
25	NC_016510	TTG	2	6	942	947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262267
26	NC_016510	TAA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262267
27	NC_016510	T	6	6	1081	1086	0 %	100 %	0 %	0 %	386262267
28	NC_016510	T	7	7	1117	1123	0 %	100 %	0 %	0 %	386262267
29	NC_016510	TTG	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262267
30	NC_016510	TCA	2	6	1141	1146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262267
31	NC_016510	TTTC	2	8	1148	1155	0 %	75 %	0 %	25 %	386262267
32	NC_016510	TAGG	2	8	1184	1191	25 %	25 %	50 %	0 %	386262267
33	NC_016510	AAT	2	6	1197	1202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262267
34	NC_016510	AAAG	2	8	1222	1229	75 %	0 %	25 %	0 %	386262267
35	NC_016510	T	8	8	1258	1265	0 %	100 %	0 %	0 %	386262267
36	NC_016510	CTA	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262267
37	NC_016510	T	6	6	1275	1280	0 %	100 %	0 %	0 %	386262267
38	NC_016510	TCT	2	6	1451	1456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262267
39	NC_016510	T	6	6	1510	1515	0 %	100 %	0 %	0 %	386262267
40	NC_016510	CTA	3	9	1541	1549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262267
41	NC_016510	ATT	2	6	1557	1562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262267
42	NC_016510	T	6	6	1674	1679	0 %	100 %	0 %	0 %	386262267
43	NC_016510	TAA	2	6	1689	1694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262267
44	NC_016510	T	9	9	1724	1732	0 %	100 %	0 %	0 %	386262267
45	NC_016510	TAC	2	6	1740	1745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262267
46	NC_016510	TG	3	6	1753	1758	0 %	50 %	50 %	0 %	386262267
47	NC_016510	TGAT	2	8	1771	1778	25 %	50 %	25 %	0 %	386262267
48	NC_016510	TCCA	2	8	1804	1811	25 %	25 %	0 %	50 %	386262267
49	NC_016510	TAA	3	9	1849	1857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262267
50	NC_016510	ATC	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262267
51	NC_016510	TTGT	2	8	1882	1889	0 %	75 %	25 %	0 %	386262267
52	NC_016510	AGA	2	6	1954	1959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262267
53	NC_016510	ACT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262267
54	NC_016510	ATGGT	2	10	2047	2056	20 %	40 %	40 %	0 %	386262267
55	NC_016510	CCT	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262267
56	NC_016510	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016510	T	6	6	2269	2274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016510	ATATTT	2	12	2279	2290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016510	T	6	6	2288	2293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016510	GTT	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016510	GAAA	2	8	2316	2323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016510	TAA	2	6	2348	2353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016510	ATT	2	6	2357	2362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016510	CAA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365959086
65	NC_016510	GAA	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365959086
66	NC_016510	GAT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959086
67	NC_016510	ACA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365959086
68	NC_016510	AGA	2	6	2600	2605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365959086
69	NC_016510	A	7	7	2615	2621	100 %	0 %	0 %	0 %	365959086
70	NC_016510	TAG	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959086
71	NC_016510	GTG	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365959086
72	NC_016510	A	7	7	2683	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	365959086
73	NC_016510	A	6	6	2699	2704	100 %	0 %	0 %	0 %	365959086
74	NC_016510	AGC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365959086
75	NC_016510	A	7	7	2750	2756	100 %	0 %	0 %	0 %	365959086
76	NC_016510	A	6	6	2771	2776	100 %	0 %	0 %	0 %	365959086
77	NC_016510	AAT	2	6	2790	2795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959086
78	NC_016510	CAT	2	6	2816	2821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959087
79	NC_016510	AGAATC	2	12	2861	2872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365959087
80	NC_016510	TGG	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365959087
81	NC_016510	GCT	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365959087
82	NC_016510	CAT	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959087
83	NC_016510	ACA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365959087
84	NC_016510	AGCG	2	8	3117	3124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016510	T	7	7	3126	3132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016510	TTTTTA	2	12	3143	3154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016510	ATG	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959088
88	NC_016510	A	8	8	3339	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	365959088
89	NC_016510	CA	3	6	3407	3412	50 %	0 %	0 %	50 %	365959088
90	NC_016510	CAT	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959088
91	NC_016510	TAG	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959088
92	NC_016510	CTA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959088
93	NC_016510	CATT	2	8	3544	3551	25 %	50 %	0 %	25 %	365959088
94	NC_016510	AAG	2	6	3611	3616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016510	T	6	6	3624	3629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016510	AGT	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016510	CTT	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959089
98	NC_016510	AGG	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365959089
99	NC_016510	AAT	2	6	3761	3766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959089
100	NC_016510	TCT	2	6	3777	3782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959089
101	NC_016510	TGTA	2	8	3789	3796	25 %	50 %	25 %	0 %	365959089
102	NC_016510	AT	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	365959089
103	NC_016510	TGAAG	2	10	3819	3828	40 %	20 %	40 %	0 %	365959089
104	NC_016510	AG	3	6	3894	3899	50 %	0 %	50 %	0 %	365959089
105	NC_016510	TTC	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959089
106	NC_016510	GTTT	2	8	3982	3989	0 %	75 %	25 %	0 %	365959089
107	NC_016510	A	8	8	4097	4104	100 %	0 %	0 %	0 %	365959089
108	NC_016510	ATTG	2	8	4117	4124	25 %	50 %	25 %	0 %	365959089
109	NC_016510	AT	3	6	4135	4140	50 %	50 %	0 %	0 %	365959089
110	NC_016510	T	6	6	4145	4150	0 %	100 %	0 %	0 %	365959089
111	NC_016510	TTC	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959089
112	NC_016510	A	6	6	4179	4184	100 %	0 %	0 %	0 %	365959089
113	NC_016510	CTT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959089
114	NC_016510	TCAA	2	8	4227	4234	50 %	25 %	0 %	25 %	365959089
115	NC_016510	A	8	8	4266	4273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016510	A	6	6	4337	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016510	T	7	7	4369	4375	0 %	100 %	0 %	0 %	365959090
118	NC_016510	CCAT	2	8	4393	4400	25 %	25 %	0 %	50 %	365959090
119	NC_016510	ATT	2	6	4521	4526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959090
120	NC_016510	ATG	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959090
121	NC_016510	A	6	6	4655	4660	100 %	0 %	0 %	0 %	365959090
122	NC_016510	TAA	2	6	4810	4815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959090
123	NC_016510	TTC	2	6	4880	4885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959090
124	NC_016510	TGT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365959090
125	NC_016510	AAG	2	6	4958	4963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365959090
126	NC_016510	GTA	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959090
127	NC_016510	AAT	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959090
128	NC_016510	ATTC	2	8	5039	5046	25 %	50 %	0 %	25 %	365959090
129	NC_016510	GTT	2	6	5144	5149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365959090
130	NC_016510	ATTT	2	8	5159	5166	25 %	75 %	0 %	0 %	365959090
131	NC_016510	T	8	8	5174	5181	0 %	100 %	0 %	0 %	365959090
132	NC_016510	GAA	2	6	5182	5187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365959090
133	NC_016510	TAG	2	6	5218	5223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959090
134	NC_016510	CTTG	2	8	5226	5233	0 %	50 %	25 %	25 %	365959090
135	NC_016510	TAT	2	6	5240	5245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959090
136	NC_016510	TTC	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959090
137	NC_016510	TTGTT	2	10	5293	5302	0 %	80 %	20 %	0 %	365959090
138	NC_016510	TTGA	2	8	5348	5355	25 %	50 %	25 %	0 %	365959090
139	NC_016510	GTAA	2	8	5393	5400	50 %	25 %	25 %	0 %	365959090
140	NC_016510	TAA	2	6	5408	5413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959090
141	NC_016510	A	6	6	5435	5440	100 %	0 %	0 %	0 %	365959090
142	NC_016510	AAT	2	6	5469	5474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959090
143	NC_016510	CT	3	6	5480	5485	0 %	50 %	0 %	50 %	365959090
144	NC_016510	TAA	2	6	5489	5494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959090
145	NC_016510	T	6	6	5514	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_016510	CAT	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959091
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155	NC_016510	TTG	3	9	6071	6079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365959091
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157	NC_016510	T	6	6	6204	6209	0 %	100 %	0 %	0 %	365959091
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163	NC_016510	T	8	8	6474	6481	0 %	100 %	0 %	0 %	365959091
164	NC_016510	TAA	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016510	TCA	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959092
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203	NC_016510	A	8	8	8010	8017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_016510	A	7	7	10654	10660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_016510	AAAAAG	2	12	10681	10692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_016510	TAT	2	6	11448	11453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959097
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404	NC_016510	A	6	6	17044	17049	100 %	0 %	0 %	0 %	365959103
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